Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlr3Q99MB1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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