Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pagr1aQ99L02 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms