Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lims1Q99JW4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms