Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ophn1Q99J31 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ophn1Q99J31 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ophn1Q99J31 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ophn1Q99J31 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ophn1Q99J31 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ophn1Q99J31 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ophn1Q99J31 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ophn1Q99J31 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ophn1Q99J31 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms