Protein–RNA interactions for Protein: Q924W5

Smc6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc6Q924W5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smc6Q924W5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms