Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarca5Q91ZW3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarca5Q91ZW3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms