Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apol9aQ8VDU3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol9aQ8VDU3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms