Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q8VDP2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8VDP2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8VDP2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8VDP2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q8VDP2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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