Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Slc6a20aQ8VDB9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Slc6a20aQ8VDB9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Slc6a20aQ8VDB9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Slc6a20aQ8VDB9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Slc6a20aQ8VDB9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Slc6a20aQ8VDB9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Slc6a20aQ8VDB9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Slc6a20aQ8VDB9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Slc6a20aQ8VDB9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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