Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ubxn4Q8VCH8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms