Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ep400Q8CHI8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms