Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Snx8Q8CFD4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx8Q8CFD4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms