Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn5Q8CBA2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slfn5Q8CBA2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms