Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ssuh2Q8C3L1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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