Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdac7Q8C2B3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdac7Q8C2B3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms