Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nhlrc2Q8BZW8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms