Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ctdsp2Q8BX07 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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