Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSK8

Rps6kb1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb1Q8BSK8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rps6kb1Q8BSK8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms