Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX1

Rnf187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf187Q8BFX1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rnf187Q8BFX1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Rnf187Q8BFX1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf187Q8BFX1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Rnf187Q8BFX1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Rnf187Q8BFX1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rnf187Q8BFX1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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Rnf187Q8BFX1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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