Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cpped1Q8BFS6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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