Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NanogQ80Z64 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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NanogQ80Z64 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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NanogQ80Z64 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NanogQ80Z64 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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