Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Lrrc27Q80YS5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Lrrc27Q80YS5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Lrrc27Q80YS5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Lrrc27Q80YS5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Lrrc27Q80YS5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Lrrc27Q80YS5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc27Q80YS5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc27Q80YS5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc27Q80YS5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc27Q80YS5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc27Q80YS5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc27Q80YS5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc27Q80YS5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc27Q80YS5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc27Q80YS5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc27Q80YS5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc27Q80YS5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
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Lrrc27Q80YS5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc27Q80YS5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lrrc27Q80YS5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms