Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Zbed4Q80WQ9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Zbed4Q80WQ9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed4Q80WQ9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms