Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcsk9Q80W65 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcsk9Q80W65 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms