Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AknaQ80VW7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms