Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cfap100Q80VN0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap100Q80VN0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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