Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcdh8Q7TSK3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcdh8Q7TSK3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcdh8Q7TSK3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcdh8Q7TSK3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcdh8Q7TSK3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcdh8Q7TSK3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcdh8Q7TSK3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcdh8Q7TSK3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcdh8Q7TSK3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcdh8Q7TSK3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcdh8Q7TSK3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcdh8Q7TSK3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcdh8Q7TSK3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcdh8Q7TSK3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcdh8Q7TSK3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcdh8Q7TSK3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcdh8Q7TSK3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcdh8Q7TSK3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcdh8Q7TSK3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcdh8Q7TSK3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcdh8Q7TSK3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcdh8Q7TSK3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcdh8Q7TSK3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcdh8Q7TSK3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pcdh8Q7TSK3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pcdh8Q7TSK3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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