Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nphp3Q7TNH6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nphp3Q7TNH6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms