Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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ScocQ78YZ6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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ScocQ78YZ6 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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ScocQ78YZ6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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ScocQ78YZ6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ScocQ78YZ6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ScocQ78YZ6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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ScocQ78YZ6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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ScocQ78YZ6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ScocQ78YZ6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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