Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trappc6aQ78XR0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trappc6aQ78XR0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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