Protein–RNA interactions for Protein: Q71B07

Dpy19l3, Probable C-mannosyltransferase DPY19L3, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpy19l3Q71B07 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dpy19l3Q71B07 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpy19l3Q71B07 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpy19l3Q71B07 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpy19l3Q71B07 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpy19l3Q71B07 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpy19l3Q71B07 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpy19l3Q71B07 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpy19l3Q71B07 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpy19l3Q71B07 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dpy19l3Q71B07 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms