Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SpopQ6ZWS8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms