Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ncapd3Q6ZQK0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd3Q6ZQK0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms