Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc44a1Q6X893 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms