Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Usp49Q6P9L4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Usp49Q6P9L4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Usp49Q6P9L4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Usp49Q6P9L4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Usp49Q6P9L4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Usp49Q6P9L4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Usp49Q6P9L4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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