Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Soga3Q6NZL0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Soga3Q6NZL0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms