Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gpbp1Q6NXH3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpbp1Q6NXH3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms