Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HelbQ6NVF4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms