Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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