Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms