Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Smarca2Q6DIC0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarca2Q6DIC0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms