Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6DFW0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6DFW0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6DFW0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q6DFW0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q6DFW0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6DFW0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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