Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzrn3Q69ZS0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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