Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Pkp4Q68FH0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Pkp4Q68FH0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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