Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fnip1Q68FD7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms