Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprdQ64487 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PtprdQ64487 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms