Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp248Q640N4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms