Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hoxa13Q62424 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms