Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbm38Q62176 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbm38Q62176 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbm38Q62176 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbm38Q62176 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbm38Q62176 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbm38Q62176 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Rbm38Q62176 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rbm38Q62176 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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