Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms